Trường THCS Ngọc Hồi được thành lập từ năm 1962 với tên gọi Trường cấp I - II Ngọc Hồi thuộc huyện Thường Tín - Hà Đông. Từ năm 1979 trường được mang tên Trường cấp I - II Ngọc Hồi thuộc huyện Thanh Trì - Hà Nội. Năm học 1996 - 1997 thực hiện quyết định số 684/QĐ - UB ngày 14/9/1996 của UBND huyện Thanh Trì về việc đổi tên trường học từ trường Phổ thông cơ sở thành trường Trung học sơ sở và từ đó đến nay trường mang tên là trường Trung học cơ sở Ngọc Hồi. Trường THCS Ngọc Hồi được xây dựng lại nằm trên địa bàn thôn Ngọc Hồi với diện tích 20.930,92 m². Khung cảnh sư phạm luôn xanh, sạch, đẹp, khang trang thoáng mát. Từ khi thành lập đến nay trường đã có nhiều đóng góp cho sự phát triển kinh tế, xã hội của địa phương. Trong xu thế hội nhập nền kinh tế quốc tế và sự phát triển như vũ bão của CNTT, của nền kinh tế xã hội nước nhà đòi hỏi cần có con người Việt Nam sáng tạo năng động, có kỹ năng sống, yêu nước, yêu chủ nghĩa xã hội.

Trong những năm qua, nhà trường đã từng bước khẳng định được uy tín, chất lượng của nhà trường so với các trường trong huyện. Nhà trường đã xây dựng được đội ngũ giáo viên đồng đều về chuyên môn, nghiệp vụ. Hằng năm, trường đều có giáo viên tham gia Hội thi giáo viên giỏi cấp Huyện, cấp Thành phố và đạt được các thành tích cao. Nhiều cán bộ, giáo viên được công nhận danh hiệu Chiến sĩ thi đua cấp cơ sở. Chất lượng giáo dục đại trà và đội tuyển học sinh giỏi, học sinh năng khiếu cấp huyện ngày một tăng cả về số lượng và chất lượng. Tỉ lệ học sinh tốt nghiệp THCS tăng hàng năm đạt từ 99% đến 100%, tỉ lệ học sinh thi đỗ vào các trường THPT công lập ngày càng tăng cao.

Trong 5 năm qua nhà trường đã có nhiều HSG, HSNK về văn hóa, thể thao, nghệ thuật đã được các cấp thẩm quyền ghi nhận. Cụ thể:

- Năm học 2020- 2021 giải văn hóa cấp Huyện có 89 giải,

- Năm học 2021 - 2022 giải văn hóa cấp Huyện có 80 giải, 02 giải văn hóa cấp Thành phố, 25 giải thi Đấu trường Toán học cấp Huyện

- Năm học 2022 - 2023 giải văn hóa cấp Huyện có 101 giải, 02 giải văn hóa cấp Thành phố, 08 giải TDTT cấp Huyện;

- Năm học 2023 - 2024 giải văn hóa cấp Huyện có 61 giải, 03 giải văn hóa cấp Thành phố, 12 giải TDTT cấp Huyện, 03 huy chương TDTT cấp Thành phố;

- Năm học 2024 - 2025: Cấp Huyện: giải văn hóa có 202 giải, 41 giải thi Đấu trường Toán học, 12 giải TDTT; Cấp Thành phố: 04 giải văn hóa cấp Thành phố, 3 giải đấu trường Toán học cấp, 03 huy chương TDTT; Cấp Quốc gia: 01 Huy chương Bạc toán học trẻ Quốc tế IMC. 

Nhiều năm liền nhà trường đạt danh hiệu trường đạt danh hiệu Tập thể lao động xuất sắc cấp Huyện. Năm học 2024 - 2025 trường được UBND thành phố Hà Nội tặng Giấy khen Tập thể lao động xuất sắc cấp Thành phố.

- Năm học 2025 - 2026: Tổng 428 giải. Trong đó:

+ Cấp xã: 10 Giải Nhất; 25 Giải Nhì; 37; Giải Ba; 54 Giải KK; Viedu: 99; ASMO: 16 giải (2 Vàng, 8 Bạc, 3 Đồng, 3 KK); TIMO: 31 giải (7 Vàng, 7 Bạc, 14 Đồng)

Hùng biện Tiếng anh: 2 giải Nhất.

+ Cấp thành phố; 01 giải Ba; Viedu: 25

+ Cấp Quốc gia: 14 ASMO (2 Vàng, 8 Bạc, 2 Đồng, 2 KK); 31 Giải TIMO (Vàng 7, Bạc 7, Đồng 17); 2 vàng IMC